EB0502 LbCas12a

产品简介

目前为止已发现6种类型和超过20种的CRISPR-Cas系统亚型。 其中,CRISPR-Cas12a是第二类(V型)用于编辑哺乳动物基因组的CRISPR-Cas系统。Cas12a具有独特的功能,可以与CRISPR-Cas9系统进行互补。Cas12a ( Cpf1) 蛋白具有类似于Cas9RuvC内切核酸酶结构域。

此外,Cpf1不具有HNH内切酶结构域,并且Cas12aN-末端不具有Cas9α-螺旋识别叶。Cas12a执行剪切后的DNA双链断裂引入了45个核苷酸突出的粘性末端。

研究表明,LbCas12a-crRNA复合物与互补单链DNA或者双链DNA的结合释放出强大的非特异性ssDNA反式切割活性,这促使Cas 12a可以作为一种新型的基因检测和成像的工具。

 

产品特点

LbCas12a (又名LbCpf1)一种由crRNA单独引导的DNA核酸内切酶,来源于Lachnospiraceae bacterium 菌株,大肠杆菌重组表达获得。

LbCas12aCas9需要富含GPAM相反,通过识别富含T5'-TTTN-3')的PAM基序来切割靶DNA

LbCas12aCas9小,且LbCas12a不需要tracrRNA,只需要crRNA较小的crRNA分子(接近Cas9的总sgRNA的一半),非常有利于基因组编辑;

 

产品规格

名称

R包装

L包装

LbCas12a Nuclease 

10 pmol/μL, 10 μL

10 pmol/μL, 100 μL

10 × LbCas12a Reaction Buffer

1 mL

1 mL


 

 

 

 

质量控制

蛋白纯度

高效液相色谱(SEC-HPLC)和SDS-PAGE检测,纯度95%

核酸外切酶残留

20 μl反应体系,10pmol本品和0.6 μg λ-Hind III37 下孵育3小时,DNA的电泳谱带不发生变化。

核酸内切酶残留

20 μl反应体系10 pmol本品和0.6μg λDNA37℃温育3 hDNA的电泳谱带无变化。

RNase残留

20 μl反应体系,10 pmol本品和2 μg RNA37℃下孵育1h

RNA的电泳谱带不发生变化。

大肠杆菌DNA残留

20μl体系中,以本品为模板,扩增 E. coli 16 s rDNA 基因,30个循环内,无扩增。 

 

适用范围

非病毒载体CRISPR基因编辑;

体外靶DNA的特异位点切割;

新型基因检测和成像等。

 

保存条件

0 ℃运输;-20℃储存,长期储存于-80 ℃,避免反复冻融。

-20 ℃条件下有效期12个月。

 

建议使用方法

1. LbCas12acrRNA序列设计参考如下:

5′–AAUUUCUACUAAGUGUAGAUNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN–3′

其中,LbCas12acrRNA包含直接重复序列 (DR区,又名Scaffold区,下划线表示),以及长度为20 nt-35nt与特异靶标序列互补配对的引导序列 (Spacer区,蓝色字体表示)。

2. 反式剪切实验,建议反应体系:

组分

体积

终浓度

10 × LbCas12a Reaction Buffer

2 μL

1 ×

10 μM LbCas12a Nuclease

0.05-0.5 μL

25-250 nM

μM crRNA

1-10 μL

100-1000 nM

Target DNA*

2 μL

 /

10 μM ssDNA Reporter

μL

500 nM

RNase Free Water

UP to 20 μL

N/A


 

 

 

 

 

 

 

 

*Target DNA可为ssDNA或带PAM序列的dsDNA

3. 实时荧光定量PCR仪检测荧光信号,37 ℃反应,每30 sec采集一次荧光信号。

 

应用实例